Trứng ruồi sẽ được nở trong 24 giờ. Bởi ruồi cái sau khi được thụ tinh, nó sẽ tìm nơi thích hợp để đẻ trứng. Đó thông thường sẽ là những bãi rác, phân hoặc các chất hữu cơ ẩm ướt trong tình trạng phân hủy. Mỗi lần sinh sản, số lượng trứng ruồi cái đẻ ra khoảng 75 – 150. Trứng ruồi có màu trắng đục và dài khoảng 1.2 mm như hạt gạo.